Доц. д-р Бони Петрунова е утвърден археолог. В обсега на нейните научни изследвания влизат български и византийски крепости от края на късната античност, българското средновековие и османския период на Балканите.
Работата й на нос Калиакра започва през 2004 година и се съсредоточава върху изследване живота хората обитавали в миналото „Красивия нос".